أولاً لا يشعر بهذا التأثير كل مستهلكي القهوة. فقط 3 أشخاص من أصل 10 يواجهون هذه الحالة. يظن معظم الناس أن الكافيين له تأثير مسهل، لكن البحث أظهر أن القهوة المنزوعة الكافيين لها أيضاً تأثير مسهل.
يعتقد العلماء أن التأثير المسهل للقهوة سببه طبيعتها الحمضية. الشيء الأول الذي اكتشفوه هو مستوى الحموضة العالي في المعدة الذي، بفضل حمض الكلوروجينيك، ينشط وظائفه. بفضل الأسيد الذي تحتوي عليه، تدفع القهوة الجسم لهضم الطعام بشكل أسرع.
شرب القهوة يزيد أيضاً نسبة ال gastrin وهو بروتيين تفرزه المعدة كي يرخي عضلات المخرج. تزيد القهوة أيضاً مستوى هورمون ال cholecystokinin الذي يفرزه غشاء الاثنا عشر (القسم الأول من الأمعاء الدقيقة). هذا الهورمون يحفز إفراز أنزيمات الصفراء وينظم إخراج الفضلات من الجسم.
